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众所周知，微生物菌剂的价格比有机肥贵一点。因此，在微生物菌剂和有机肥之间，很多人倾向于选择价格便宜的有机肥。这其实是一个很大的错误，因为贵，贵有它的好处！现在市场上的有机肥一般含有45种有机质，可以增加土壤有机质，改善土壤理化性状。增加有机肥的使用量，不断提高土壤有机质含量，是提高土壤肥力的主要环节。有机质能增加土壤通气性、透水性、蓄水量，改善根系生长环境，使土壤保水保肥能力增强。菌剂中含有大量的氮、磷、钾元素和一些有机物。主要添加微生物活性菌。首先，从生产成本上来说，肯定要高于有机肥。更重要的是，微生物菌剂有其独特的功能，下面给大家具体介绍菌肥的几种功能。
1、提高果实品质
2、分解有机物和毒素，防止农作物重茬
3、保护农作物根系健康，组织病菌入侵。
4、达到生物防治病害的效果，灌根可抑制土壤中的病菌，喷到叶面，可防止病害的入侵。
5、增强农作物的抗逆性，增强抗病虫害能力。解磷、解钾的同时，能够促使土壤中微量元素的释放，被作物所利用，同时有益菌代谢产生多种植物所需的物质，如小分子氨基酸、生长刺激物质、维生素等。达到生物防治病害的效果，灌根可抑制土壤中的病菌，喷到叶面，可防止病害的入侵。
6、松土、保肥、改善环境、减少土壤板结。通过有益菌的大量繁殖，大量有益菌在植物的根系周围形成了优势种群，抑制了其他有害菌的生命活动。
7、快速分解土壤有机物质，促进土壤团粒的形成，且通过有益菌的活动能够疏松土壤，土壤的保肥、供肥、保水、供水及透气性都得到很好的调节。分解土壤中的农药残留，避免残留农药对下季作物产生药害。还对植物生长过程通过根系排放的有害物质进行分解。
虽然微生物菌剂比有机肥贵一点，但微生物菌剂在最终的增产增收方面更具性价比！
微生物菌剂与菌肥区别
微生物菌剂和生物有机肥从标准含量都不一样，严格说微生物菌剂更加高级一些。
微生物菌剂，用国家标准GB20287-2006的，菌每克大于2亿每克，没有有机质的要求。
生物有机肥，用国家标准NY884-2012，菌每克大于2000万，有机质大于40，就可以了。
菌肥一般配合有机肥，用在底肥上，微生物菌剂，一般可以全部水溶，苗期或者中后期可以冲施。不过这两年，很多企业也做了很多，菌剂用来做底肥。
两者对改良土壤都有作用。
对于不同的作物以及不同的土壤环境，从而选择不同的肥料类型。生物菌肥和生物菌肥一般可用于有机栽培。
以下是他们之间的区别生物菌肥
（GB 20287-2006）-行业标准
生物菌肥是近几年出现的一种新型的生物“肥料”，虽然叫做菌肥，但是其本质不是肥，只是通过培养的一些在土壤中有利于土壤和作物的有益菌类。
有机肥料
（NY-525-2012）-行业标准
指主要是来源于植物和（或）动物，经过发酵腐熟的含碳有机物料，其功能是改善土壤肥力，提供植物营养，提高作物品质。适用于以?畜禽粪便、动植物残体和以动植物产品为原料，并经发酵腐熟后制成的有机肥料。
生物有机肥
（NY-884-2012）-行业标准
指特定功能微生物与主要以动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理、腐熟的有机肥料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。
如果说效果的话生物有机肥优于普通商品有机肥
有机肥
专指以各种动物废弃物（包括动物粪便；动物加工废弃物）和植物残体（饼肥类；作物秸秆；落叶；枯枝；草炭等）为原材料，采用物理、化学、生物或三者兼有的处理技术，经过一定的加工工艺（包括但不限于堆制；高温；厌氧等），消除其中的有害物质（病原菌、病虫卵害、杂草种籽等）达到无害化标准而形成的，符合国家相关标准（NY 525-2012）及法规的一类肥料。
有机肥经生物物质、动植物废弃物、植物残体加工之后，消除了其中的有毒有害物质，富含大量有益物质，包括：多种有机酸、肽类以及包括氮、磷、钾在内的丰富的营养元素。不仅能为农作物提供全面营养，而且肥效长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性，是绿色食品生产的主要养分。
生物菌肥
生物菌肥是近几年出现的一种新型的生物“肥料”，虽然叫做菌肥，但是其本质不是肥，只是通过一些工厂的手段培养的一些在土壤中有利于土壤和作物的有益菌类。
分类
有固氮作用的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮蓝藻等；
分解土壤有机物的菌肥：包括有机磷细菌和复合细菌等；
分解土壤中难溶性矿物的菌肥：包括硅酸盐细菌、无机磷细菌等；
促进作物对土壤养分利用的菌肥：包括菌根菌等；
抗病及刺激作物生长的菌肥：包括抗生菌、增产菌等。
优势
三种以上多种复合菌相互促进、相互补充，抗土传病害效果远远大于单一菌种。有益菌群相互协同，共同作用，能使作物达到高产丰产的效果。
提高作物产量
改善作物品质
增强作物抗逆性
提高化肥利用率
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