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（1）提高土壤肥力。这是微生物肥料的主要功效，例如各种自生、联合或共生的固氮生物肥料，可以固定空气中的氮素，增加土壤中的含氮量；多种分解磷钾矿物的微生物，如硅酸盐细菌能分解土壤中的钾长石、云母及磷矿石，使其中难溶的磷、钾有效化。

（2）制造和协助农作物吸收营养。有些菌肥施用后，由于微生物的活动，不仅能增加土壤有效养分，还能产生多种激素类物质和各种维生素，从而促进作物的生长；根瘤菌肥中的根瘤菌向豆科植物一生提供的氮素占其一生需要量的30%～80%；VA菌根是一种土壤真菌，它可以与多种植物根共生，其菌丝伸出根部很远，可以吸收更多的营养供各种植物利用，其中以对磷的吸收最为明显。

（3）增强植物的抗逆性。有些微生物肥料的菌种接种后，由于在作物根部大量生长繁殖，成为作物根际的优势菌，它们可分泌抗真菌和细菌的抗生素，从而抑制多种病菌的生长。VA菌根的菌丝则由于在作物根部的大量生长，除了可以吸收有益于作物生长的营养元素外，还可以增加作物对水分的吸收，提高作物的抗旱能力。

微生物有机肥和农家肥都属于有机肥的一种，而现在经常说的有机肥是指商品有机肥。

首先要区别农家肥、有机肥和微生物有机肥三种的不同。

什么是农家肥

农家肥包括动物粪便、饼粕、草木灰、酒糟、绿肥、生活垃圾等。农家肥是有机物腐熟发酵沤制的一种肥料，池塘淤泥、农作物下脚料、腐殖酸等都算农家肥。农家肥不仅含有氮磷钾大量元素，而且含有丰富微量元素，农家肥肥效长，利用率高，但肥效不如化肥来得快。农家肥施一次能管几季，深受农民喜爱，现在蔬菜水果种植上大多采用农家有机肥。

农家肥能改良土壤，增加土壤有机质，防止土壤板结，调节土壤pH值。但农家家必须充分发酵腐熟才能使用，如果不发酵腐熟，施入土壤，会二次发酵，有“烧苗”、烂根现象，同时，农家肥会携带病菌虫卵进入土壤，诱发农作物病虫害，绿肥、饼肥也要沤肥发酵腐熟才能使用。

什么是商品有机肥

有机肥为:“有控制地通过生物分解有机废弃物后得到的产物，在分解过程中产生的热量可使原材料得到无害化和稳定化以有益于植物生长，其物理性质与初始的原材料已截然不同。堆肥是一种有机质资源，其特有的性质可以改善土壤或生长基质的化学、物理和生物性质，它虽含有植物养分，但还不是一种典型肥料”。

国内对有机肥的理解是，指在人工控制和一定的水分、C/N和通风条件下通过微生物的发酵作用，将废弃有机物（主要是农业废弃物）转变为肥料的过程。通过堆肥化过程，有机物由不稳定状态转变为稳定的腐殖质物质，其产品不含病原菌，不含杂草种子，而且无臭无蝇，可以安全处理和保存，是一种良好的土壤改良剂和有机肥料。

有机肥在堆肥化过程实际上也是一种脱水工艺，而且由于其主要依赖微生物作用，不需要外部能量，因此往往具有低投入、低成本、产品增值使用等特征，受到废物处理界的欢迎。

什么是生物有机肥

生物有机肥就是在有机肥中添加了一些有益微生物菌类，目前这类肥料在市场上的交易量也是比较大的。这类肥料的有机肥载体比较多，这类肥料的质量差别比较大，主要还在于微生物菌类的有效微生物活性数量方面的差异。这类肥料也存在着添加的微生物菌类的活性不足的情况，大家在选择这类肥料的时候一定要仔细的鉴别。

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